福佑寺布局规范,结构严谨。高大的红墙,黄色的琉璃瓦,巍峨的殿宇,一副皇家建筑气派。第三进院落,为乾隆御撰《喇嘛说》碑亭,亭内《喇嘛说》碑以满、汉、蒙、藏四种文字写成;东西两侧是四学殿,即讲经殿、密宗殿、药师殿、数学殿,分别是喇嘛僧学习佛经、医药、天文、地理等知识的场所;院正北是雍和宫殿,内供三世佛。第四进院落的正殿为法轮蓼,内供黄教创始人宗喀巴大师像,四周墙壁均为佛教故事壁画,人保存有藏文《大藏经》、《续藏经》315部;大两侧为班禅楼和戒台楼,班禅楼展室展示了雍和宫历代喇嘛生活用品及大量精致法器与佛像近300件;戒台楼展室展出转世灵童抽签用的金奔巴瓶及部分乾隆时期的文物。
福佑寺的乘车线路是乘5路车到北海站下车,沿北长街向南200米路东即是。